Kluuvikadun kahvilassa aloitettiin myös ruokaleivän leivonta, aluksi pienessä mittakaavassa. Suomalaisesta ruisleivästä tuli tärkeä osa leipomotoimintaa vuonna 1958, jolloin Fazer osti Oululaisen leipomon. Oululaisen laajassa leipävalikoimassa oli kaksi tuotetta ylitse muiden, jälkiuunileipä ja hapankorppu. Niiden suosiota eivät kuluneet vuosikymmenetkään ole horjuttaneet.

Fazerilla oli aluksi Helsingissä omat leipämyymälät. Vuodesta 1952 lähtien on tuoretta leipää toimitettu vähittäiskauppojen myyntiin.

Innovointi on myös leipomotoiminnassa tärkeää. Fazer toi kauppoihin Suomen ensimmäiset myyntipakkauksiin valmiiksi viipaloidut paahtoleivät vuonna 1966. Tuohon aikaan leivänpaahtimista tuli suosittu häälahja nuorille pareille. Nykyään paljon voimavaroja suunnataan muun muassa ruisleivonnan ja rukiisten raaka-aineiden kehittämiseen ja tutkimukseen.