Война повлияла на Fazer во многих отношениях. В 1940 году было остановлено производство шоколада, а количество сахара и жиров в печенье уменьшилось. Фабрика Fazer по изготовлению печенья в городе Ханко была эвакуирована и перенесена в Хельсинки. Подразделения Fazer занимались производством макарон для сил обороны.

Во время войны импорт сахара и какао-бобов существенно уменьшился, поэтому пришлось искать им замену. Продукт под названием «Ravitol» был изготовлен из свекольного сиропа и жареных бобов, его вкус «смутно напоминал какао». Среди товаров военного времени был брусничный мармелад, мармелад из яблок и ягод рябины, морковно-яблочный мармелад и различные виды печенья. Производство лакрицы временами приостанавливалось: часть необходимого сырья передавалась медицинским организациям. В 1947 году, вдохновленный подписанием Парижского мирного договора, Fazer запустила производство лакричных пастилок Pax. В 1949 году были сняты ограничения в отношении шоколада, что позволило возобновить производство изделий по старым рецептам.